Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H5

Trim42, Tripartite motif-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim42Q9D2H5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Trim42Q9D2H5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms