Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J3

Sarnp, SAP domain-containing ribonucleoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SarnpQ9D1J3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
SarnpQ9D1J3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SarnpQ9D1J3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms