Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1J1

Necap2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necap2Q9D1J1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Necap2Q9D1J1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms