Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tspan11Q9D1D1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tspan11Q9D1D1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms