Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M1

Prpsap1, Phosphoribosyl pyrophosphate synthase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpsap1Q9D0M1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Prpsap1Q9D0M1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prpsap1Q9D0M1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms