Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN7

Shmt2, Serine hydroxymethyltransferase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shmt2Q9CZN7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Shmt2Q9CZN7 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Shmt2Q9CZN7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms