Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nde1Q9CZA6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nde1Q9CZA6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms