Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Mis12Q9CY25 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Mis12Q9CY25 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms