Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXZ1

Ndufs4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs4Q9CXZ1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ndufs4Q9CXZ1 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms