Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX30

Yif1b, Protein YIF1B, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yif1bQ9CX30 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yif1bQ9CX30 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yif1bQ9CX30 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yif1bQ9CX30 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yif1bQ9CX30 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yif1bQ9CX30 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms