Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpusd4Q9CWX4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpusd4Q9CWX4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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