Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cxxc1Q9CWW7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms