Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tdrd12Q9CWU0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms