Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MINDY3Q9CV28 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MINDY3Q9CV28 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms