Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Q9CRC3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Q9CRC3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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