Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA4

Msmo1, Methylsterol monooxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msmo1Q9CRA4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Msmo1Q9CRA4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Msmo1Q9CRA4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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