Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR42

Ankrd1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd1Q9CR42 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd1Q9CR42 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ankrd1Q9CR42 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms