Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
4931417E11RikQ9CR05 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
4931417E11RikQ9CR05 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms