Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQZ7

Polr3k, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC10, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3kQ9CQZ7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr3kQ9CQZ7 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Polr3kQ9CQZ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Polr3kQ9CQZ7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms