Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Atg12Q9CQY1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Atg12Q9CQY1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms