Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP3

Chchd5, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd5Q9CQP3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Chchd5Q9CQP3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Chchd5Q9CQP3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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