Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nicn1Q9CQM0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Nicn1Q9CQM0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Nicn1Q9CQM0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Nicn1Q9CQM0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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