Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nipsnap3bQ9CQE1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms