Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
StambpQ9CQ26 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms