Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW5

Ssr2, Translocon-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr2Q9CPW5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ssr2Q9CPW5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ssr2Q9CPW5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms