Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ska1Q9CPV1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ska1Q9CPV1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms