Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gtf2a1Q99PM3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gtf2a1Q99PM3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms