Protein–RNA interactions for Protein: Q99PJ2

Trim8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim8Q99PJ2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim8Q99PJ2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms