Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gtf2ird2Q99NI3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gtf2ird2Q99NI3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms