Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gdpd3Q99LY2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gdpd3Q99LY2 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms