Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Chmp1b1Q99LU0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Chmp1b1Q99LU0 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms