Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
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Sh3bp5lQ99LH9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sh3bp5lQ99LH9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sh3bp5lQ99LH9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms