Protein–RNA interactions for Protein: Q99LC5

Etfa, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EtfaQ99LC5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
EtfaQ99LC5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EtfaQ99LC5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms