Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmp1Q99KU0 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmp1Q99KU0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms