Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Clint1Q99KN9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Clint1Q99KN9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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