Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tmed9Q99KF1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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