Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Lims1Q99JW4 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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