Protein–RNA interactions for Protein: Q99J78

Def8, Differentially expressed in FDCP 8, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Def8Q99J78 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Def8Q99J78 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Def8Q99J78 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms