Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Ctu1Q99J10 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctu1Q99J10 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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