Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
SptssbQ925E8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC9.21□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
SptssbQ925E8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms