Protein–RNA interactions for Protein: Q923W1

Tgs1, Trimethylguanosine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgs1Q923W1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tgs1Q923W1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tgs1Q923W1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms