Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TardbpQ921F2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TardbpQ921F2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms