Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

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Length 698 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nek8Q91ZR4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Nek8Q91ZR4 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nek8Q91ZR4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms