Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Prpf6Q91YR7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Prpf6Q91YR7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms