Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rrp1bQ91YK2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms