Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Snx15Q91WE1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms