Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klc3Q91W40 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klc3Q91W40 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms