Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp3Q91W36 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp3Q91W36 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms