Protein–RNA interactions for Protein: Q91VT1

Nsmce2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce2Q91VT1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Nsmce2Q91VT1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Nsmce2Q91VT1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms