Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Capn8Q91VA3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capn8Q91VA3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms